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多房棘球蚴抗原蛋白TSP3抗原表位的生物信息学预测


□ 庞明泉[1,3];汤锋[2,3,4];周虎[1,3];万陈飞[1,3];阳丹才让[1,3,4];樊海宁[1,3,4]

青海大学附属医院肝胆胰外科 青海西宁811001 青海大学医学院高原医学研究中心 青海西宁810001 青海大学高原人畜共患病研究所 青海西宁810001 青海省包虫病研究重点实验室 青海西宁810001

摘 要:

目的预测多房棘球绦虫抗原蛋白TSP3的二级结构和优势抗原表位(T细胞和B细胞表位)。方法Genbank获取TSP3的氨基酸序列后通过生物信息学软件SOPMA预测二级结构特征,进一步通过在线软件IEDB、SYFPEITHI、Bcepred和ABCpred预测TSP3的T细胞和B细胞表位。同时对r11sP3的亲抽性、柔韧性、抗原性及蛋白表面暴露区域的特征进行预测。结果无规则卷曲和B转角分别占TSP3蛋白质的二级结构的25.68%和4.05%,说明潜在优势抗原性表位存在。通过多种生物信息学方法分析出TSP3潜在的T细胞表位为T33-42、T45-55、T53-63、T68-77、T80-90、T92-104、T110-122、T134-144;TSP3潜在的B细胞表位为T18-33、T45-55、T53-63、T64-75、T80-90、r1192-104、T110-122。结论TSP3的二级结构特征显示潜在优势抗原性表位存在,预测出8种T细胞抗原表位和7种B细胞抗原表位,为后续表位疫苗的设计奠定了理论基础。

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